Die Besonderheit des Atlas sind neuartige naturnahe Karten, die das abwechslungsreiche Mosaik der Natur- und Kulturlandschaften mit freundlichen, nach assoziativen Prinzipien gewählten Farben, und plastisch wirkender Reliefschummerung darstellen. Dazu kommen brillante Fotos der Lebensräume, anschauliche Zeichnungen bedrohter Tier- und Pflanzenarten sowie kurze leicht verständliche Texte, Diagramme und Tabellen.
Die ausgewogene Kombination von Karten, Grafik und Typografie, der Druck und die buchbinderische Verarbeitung sollen ein hochwertiges und besonders schönes Kartenbuch mit wissenschaftlichem Hintergrund entstehen lassen.
So kann eine große Leserschaft für Naturschutzbelange und speziell zum Thema Natura 2000 interessiert werden. Außerdem wird mit dem Atlas allen am Management von Natura-2000-Gebieten beteiligten Behörden, Planungsbüros, Universitäten und nicht zuletzt den Verbänden aus den Bereichen Land- und Forstwirtschaft, Jagd, Sport, Tourismus und Naturschutz eine wertvolle Informationsquelle und ein geeignetes Mittel für die Öffentlichkeitsarbeit in die Hand gegeben.
Erfahrungen zeigen, dass sich Leser von einem Buch besonders angesprochen fühlen, wenn es die eigene Heimat zum Thema hat. Deshalb soll der Atlas das Thema Natura 2000 regional begrenzt für ein Bundesland in aller Ausführlichkeit und sehr detailliert darstellen.
Der Atlas Thüringen - Natura 2000 kann als innovatives Produkt europaweit, vor allem aber für andere Bundesländer Deutschlands, Bedeutung als Pilotprojekt haben.